Некоммерческая благотворительная организация Благотворительный фонд В. Потанина зарегистрирована Московской регистрационной палатой 10 января 1999 года. 
Благотворительный фонд В. Потанина учрежден для реализации социально значимых долгосрочных проектов в области отечественного образования и культуры. Благотворительный фонд В. Потанина - частный фонд, бюджет которого формируется из личных средств Владимира Потанина. 
Миссия фонда – содействовать развитию стратегической благотворительности и становлению активных, творческих профессионалов. Фонд работает с теми, кто способен изменять себя и готов помогать развитию российского общества. Фонд формирует общественную среду, где ценностями являются творчество, профессионализм, добровольческая активность.
Фонд действует в соответствии со следующими принципами:
- работать по открытым правилам, создавать одинаковые условия для всех участников проектов и программ фонда через конкурсные механизмы 
- оставаться лидером в своем деле, не бояться экспериментировать и использовать новые технологии в своих программах; творчески осваивать российский и международный опыт благотворительной деятельности;
- взаимодействовать с профессиональными партнерами.
Важнейшим направлением деятельности фонда является проведение долгосрочных стипендиальных и грантовых программ, которые адресованы талантливым студентам и курсантам, обучающимся в ведущих государственных учебных заведениях России, а также перспективным преподавателям. 
Проекты поддержки культуры составляют другую, не менее важную сферу деятельности фонда. Его усилия направлены на стимулирование профессионального и творческого роста российского музейного сообщества. Фонд стремится поддерживать инициативы активных и творческих музейных профессионалов, способных обеспечить культурный прорыв. 
Ежегодно фонд выплачивает более 400 грантов и 2300 стипендий. 
Благотворительный фонд В. Потанина является членом Европейского центра фондов, учредителем и членом Российского форума доноров.